@kizakiaoi おかげで解決しました！ご丁寧にありがとうございます！

ディバイド、Zリメッシャー、ダイナメッシュなどを使用すると画像のように穴が勝手に埋まり、一部が伸びてしまいます。
原因や対処法を教えてはいただけないでしょうか。